El uso de estos biomarcadores en la clínica permitiría evitar efectos secundarios y aplicar un tratamiento más eficaz.
“Hemos hallado la manera de hacer medicina de precisión con quimioterapias estándar”, afirma Geoff Macintyre, investigador del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO).
“La investigación se ha publicado en la revista ‘Nature Genetics’.
La tecnología se validará ahora en un entorno hospitalario, gracias a un proyecto financiado por el ministerio para la Transformación Digital y de la Función Pública.
La quimioterapia busca acabar con las células tumorales mediante fármacos, y es desde hace décadas un tratamiento habitual contra el cáncer. Sin embargo, no siempre da buen resultado. “Las quimioterapias son buenas para algunos pacientes, pero no son efectivas en todos los casos. Entre un 20% y un 50% de los enfermos de cáncer no responden a estos fármacos”, explica Geoff Macintyre, jefe del Grupo de Oncología Computacional del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO). “Estos pacientes sufrirán efectos secundarios causados por la quimioterapia, sin ningún beneficio clínico”.
El equipo liderado por Macintyre, en colaboración con la Universidad de Cambridge y la empresa spin off Tailor Bio, ha desarrollado un método que predice en qué pacientes no serán eficaces los tratamientos estándar con quimioterapias de uso frecuente, basados en los compuestos con platino, taxanos y antraciclinas.
“Hemos hallado la manera de hacer medicina de precisión con quimioterapias estándar”, afirma Macintyre. El trabajo se publica en Nature Genetics, con los investigadores Joe Sneath Thompson y Bárbara Hernando, del CNIO, y Laura Madrid, de Tailor Bio como primeros autores.
“Es importante destacar que nuestro estudio introduce biomarcadores que permiten la estratificación de pacientes cuando se emplean múltiples quimioterapias no desarrolladas originalmente como terapias dirigidas”, escriben en Nature Genetics.
“Hemos desarrollado un test genómico que permite que tres quimioterapias estándar se usen de forma dirigida, es decir, en pacientes que sabemos que pueden responder a ellas”, explica Thompson. “Este test puede aplicarse a diferentes tipos de cáncer; nuestros resultados pueden beneficiar a unos cientos de miles de pacientes al año”.
Reconocer cada tumor por las alteraciones en los cromosomas
El método desarrollado por el equipo del CNIO se basa en el hecho de que muchos tumores acumulan alteraciones o cambios en el número de cromosomas de sus células. Una consecuencia, explica Laura Madrid, es que “las células cancerosas no tienen la cantidad de material genético adecuado”.
Estas alteraciones son diferentes en cada tumor, de manera que su conjunto conforma un patrón característico, una firma de inestabilidad cromosómica. El estudio ahora publicado desarrolla biomarcadores basados en estas firmas de inestabilidad cromosómica.
Estos biomarcadores permiten “detectar con antelación qué pacientes son resistentes a estos tratamientos para poder elegir otros alternativos y más eficaces, con lo que se evitarían efectos secundarios innecesarios”, explica Macintyre.
El uso preciso de la quimioterapia beneficia no solo a los pacientes, sino al sistema en su conjunto: al reducirse el gasto en terapias ineficaces, y en tratar complicaciones relacionadas con los efectos secundarios de la terapia, disminuye el gasto sanitario.
Bárbara Hernando, Geoff Macintyre y Joe Sneath Thompson, a la entrada del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO). /CNIO
Validados con datos de más de 800 pacientes
Una vez desarrollados los biomarcadores, el equipo del CNIO puso a prueba sus biomarcadores de manera innovadora: con un ensayo emulado, es decir, con datos ya existentes. Los autores recurrieron a gran cantidad de datos procedentes de pacientes con cáncer que ya habían sido tratados con las quimioterapias analizadas en el estudio.
En concreto, el grupo trabajó con datos de 840 pacientes con diferentes tipos de cáncer. “Hemos utilizado datos de pacientes con cáncer de mama, próstata, ovario y sarcoma”, indica Hernando. Así han logrado demostrar la eficacia de los biomarcadores de resistencia que proponen ante alguno de los tres tipos de quimioterapia evaluados –basadas en los compuestos platino, taxanos y antraciclinas–.
Este estudio ha sido posible gracias al apoyo del Instituto de Salud Carlos III, el Ministerio de Ciencia e Innovación, Cancer Research UK y la Fundación “la Caixa”.
Ensayo para llevar esta tecnología a la clínica
Para llevar este conocimiento a la clínica, la tecnología desarrollada por los investigadores del CNIO debe ser ahora validada en un entorno hospitalario.
El grupo ya ha recibido para ello financiación del Ministerio para la Transformación Digital y de la Función Pública. Este proyecto, en colaboración con la empresa spin off Tailor Bio y el Hospital Universitario 12 de Octubre (H12O), evaluará la integración de la tecnología en el sistema sanitario analizando muestras ya disponibles de pacientes. Esto demostrará que la tecnología está lista para utilizarse en ensayos clínicos en 2026.
“Llevar un biomarcador de la fase de descubrimiento a la clínica no suele ser sencillo. Pero con persistencia y colaboración es posible convertir un proyecto de investigación en una tecnología realmente prometedora desde el punto de vista clínico”, dice Macintyre.
Este nuevo estudio de validación ha recibido financiación de la Unión Europea a través del Mecanismo de Recuperación y Resiliencia, fondos NextGenerationEU, Plan de Recuperación Transformación y Resiliencia (Componente 16, Reforma 1), Ministerio para la Transición Digital y Función Pública.
Sobre el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)
El Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO) es un centro público de investigación dependiente del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Es el mayor centro de investigación en cáncer en España y uno de los más importantes en Europa. Integra a medio millar de científicos y científicas, más el personal de apoyo, que trabajan para mejorar la prevención, el diagnóstico y el tratamiento del cáncer.
Artículo de referencia
Joe Sneath Thompson, Laura Madrid, Barbara Hernando, Carolin M. Sauer, Maria Vias, Maria Escobar-Rey, Wing-Kit Leung, Diego Garcia-Lopez, Jamie Huckstep, Magdalena Sekowska, Karen Hosking, Mercedes Jimenez-Linan, Marika A. V. Reinius, Abhipsa Roy, Omar Abdulle, Justina Pangonyte, Harry Dobson, Amy E.Cullen, Dilrini De Silva, David Gómez-Sánchez, Marina Torres, Ángel Fernández-Sanromán, Deborah Sanders, Filipe Correia Martins, Ionut-Gabriel Funingana, Giovanni Codacci-Pisanelli, Miguel Quintela-Fandino, Florian Markowetz, Jason Yip, James D. Brenton, Anna M. Piskorz, Geoff Macintyre, ‘Predicting resistance to chemotherapy using chromosomal instability signatures’, Nature Genetics (2025)
DOI: 10.1038/s41588-025-02233-y
Fuente: www.cnio.es
